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全球首款丨家驴基因检测和品种选育产品——“家驴一号”液相芯片研发成功当前焦点

时间：2023-04-18 15:27:19 来源：中国农科新闻网发布者：DN032

(相关资料图)

日前，“家驴一号”全球首款家驴基因组检测液相芯片由西北农林科技大学动物科技学院党瑞华课题组联合青岛农业大学孙玉江教授团队和博瑞迪生物技术有限公司联合研发。

该芯片是基于党瑞华和孙玉江博士团队长期积累的国内外驴种性状测定和全基因组数据设计，结合博瑞迪GBTS技术体系中的GenoBaits®技术，创制出的具有国内完全自主知识产权的“中国芯”。

该产品的发布可为中国家驴种源鉴别、资源保护、血统鉴定、亲子鉴定、分子标记辅助育种和全基因组选择育种提供高效、低价的应用工具，其相关研究成果也将为中国家驴专门化品种选育工作提供有力的技术支撑和指导依据。

众所周知，国内肉驴市场潜力大，驴肉和驴皮供不应求。但养殖端效益并不高的一个重要原因是缺乏专门化驴品种。为解决传统育种周期长的痛点，充分利用我国丰富的家驴品种资源，“家驴一号”利用基因组选择技术，可在选育早期评估种驴的育种值，帮助牧场做出正确育种决策。本产品是全球首款家驴基因检测和品种选育产品，将为驴品种鉴定、资源保护、本品种选育等工作提供有效的辅助。

该芯片设计基于中国家驴16个品种包括西藏驴、云南驴、淮北灰驴、新疆驴、吐鲁番驴、和田青驴、泌阳驴、德州驴、滚沙驴、关中驴、佳米驴、庆阳驴、凉州驴、太行驴、广灵驴、库伦驴共165头，国外驴品种82头（吉尔吉斯斯坦驴7头、肯尼亚驴17头、尼日利亚驴6头、埃及驴8头、埃塞俄比亚驴10头、西班牙驴18头、伊朗驴8头、澳大利亚驴8头）及野驴7头的全基因组测序结果，包含品种多，筛选获得共45,894个SNP位点，适用性广。

芯片共有45,894个SNP标记，均匀分布在全基因组范围，能在低成本的基础上，有效地捕获因果突变及连锁单倍型。在早期选育阶段，可利用先验GWAS结果，提高基因组选育工作的进展，制定合理的选配策略。另外，芯片密度可以灵活调整，随时补充位点。

SNP检出率是衡量芯片质量的重要指标，一般用常染色体和X染色体的位点进行衡量。经样本测试，“家驴一号”的SNP平均检出率为98.5%—99.1%，均超出95%的标准检出率，表明“家驴一号”的基因型检测质量良好。

此外，应用“家驴一号”的SNP位点集合开展的驴群体遗传结构分析，可清晰地将中国家驴与外国驴品种区分开，表明该产品适用于驴群体遗传多样性研究和分析。

全媒体记者郭媛媛通讯员赵兴

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